December 7, 2006 at 9:31 am | Posted in open source everything | 2 Comments

Δύο διεκδηκητές, ένα βραβείο, η κούρσα: η αποκωδικοποίηση τριών δισεκατομμυρίων νουκλεωτιδίων για την χαρτογράφηση του ανθρώπινου γονιδιώματος. Οι δύο διεκδικητές είναι η το International Human Genome Project και η ιδιωτική εταιρεία Celera Genomics.

To International Human Genome Project (IHGP) είναι μια διεθνής προσπάθεια στην οποία εκτός από τις Ηνωμένες Πολιτείες και την Μεγάλη Βρετανία που ηγούνται της προσπάθειας συμμετέχουν γενετιστές από την Κίνα, την Γαλλία, την Γερμανία, την Ιαπωνία και άλλα κράτη. Παρά τις διάφορες ανακοινώσεις η αποκωδικοποίηση δεν έχει ολοκληρωθεί καθώς η αποκωδικοποίηση των βάσεων στα κεντρομερή και τα τελομερή των χρωμοσωμάτων είναι εξαιρετικά δύσκολη αν όχι αδύνατη. Μέχρι στιγμής το 92% του γονιδιώματος έχει χαρτογραφηθεί. Τα αποτελέσματα των ερευνών του IHGP ανανεώνονται σε καθημερινή βάση και προστίθενται στο Genbank μια διαδικτυακή βάση δεδομένων προσβάσιμη από κάθε επιστήμονα το ιδιαίτερου αυτού τομέα

Η Celera Genomics χρησιμοποιεί μια διαφορετική προσέγγιση στην έρευνα της υποστηρίζοντας ότι με προϋπολογισμό μόλις 300 εκατομμυρίων δολαρίων σε σύγκριση με τα 3 δισεκατομμύρια δολάρια του IHGP μπορεί να αποκωδικοποιήσει το ανθρώπινο γονιδίωμα και μάλιστα σε μικρότερο χρονικό διάστημα. Η εταιρεία έχει αιτηθεί 6500 χιλιάδες “αρχικές” πατέντες σε ολοκληρωμένα ή τμήματα γονιδίων.
Η Celera αρνήθηκε να καταθέσει τα μέχρι τώρα ευρήματα της στην Genbank ώστε να είναι διαθέσιμα στους ερευνητές.

Τα οφέλη από την διάθεση του ανθρώπινου γονιδιώματος στους ερευνητές είναι σημαντικότατα. Με την εξέλιξη της βιοχημείας οι γνώσεις μας για το ανθρώπινο γονιδίωμα είναι τόσο σημαντικές όσο η ανατομία για την σύγχρονη ιατρική. Ήδη με την χρήση των δεδομένων από το IHGP οι επιστήμονες προχωρούν στο International HapMap Project που έχει στόχο των εντοπισμό των απλοειδών που απαρτίζουν το ανθρώπινο γονιδίωμα.

Advertisements

2 Comments »

RSS feed for comments on this post. TrackBack URI

  1. Να σημειώσω οτι η Celera χρησιμοποιεί τη μέθοδο shotgun sequencing, αντίθετα με το IHGP που χρησιμοποιεί παραδοσιακότερες μεθόδους. Το shotgun sequencing είναι πολύ πιο γρήγορη μέθοδος, αλλά αρκετοί εγείρουν αμφιβολίες για την ακρίβειά της.

  2. ναι από όσο γνωρίζω είναι περισσότερο εκτεταμένη η χρήση της σε βακτηριδιακές εφαρμογές και όχι σε τόσο μεγάλα project


Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s

Blog at WordPress.com.
Entries and comments feeds.

%d bloggers like this: